Gen za odpornost na karbapeneme (KPC/NDM/OXA 48/OXA 23/VIM/IMP)
Ime izdelka
Komplet za detekcijo gena odpornosti na karbapeneme HWTS-OT045 (KPC/NDM/OXA 48/OXA 23/VIM/IMP) (fluorescenčna PCR)
Epidemiologija
Karbapenemski antibiotiki so atipični β-laktamski antibiotiki z najširšim antibakterijskim spektrom in najmočnejšim antibakterijskim delovanjem. Zaradi svoje stabilnosti na β-laktamaze in nizke toksičnosti je postal eno najpomembnejših antibakterijskih zdravil za zdravljenje hudih bakterijskih okužb. Karbapenemi so zelo stabilni na plazmidno posredovane β-laktamaze razširjenega spektra (ESBL), kromosome in plazmidno posredovane cefalosporinaze (encimi AmpC).
Kanal
PCR-mešanica 1 | PCR-mešanica 2 | |
FAM | IMP | VIM |
VIC/HEX | Notranji nadzor | Notranji nadzor |
5. cikla | NDM | KPK |
ROX | OXA48
| OXA23 |
Tehnični parametri
Shranjevanje | ≤-18 ℃ |
Rok uporabnosti | 12 mesecev |
Vrsta vzorca | Sputum, čiste kolonije, rektalni bris |
Ct | ≤36 |
CV | ≤5,0 % |
LoD | 103CFU/ml |
Specifičnost | a) Komplet zazna standardizirane negativne reference podjetja in rezultati izpolnjujejo zahteve ustreznih referenc. b) Rezultati testa navzkrižne reaktivnosti kažejo, da ta komplet nima navzkrižne reakcije z drugimi respiratornimi patogeni, kot so Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Streptococcus pneumoniae, Neisseria meningitidis, Staphylococcus aureus, Klebsiella oxytoca, Haemophilus influenzae, Acinetobacter junii, Acinetobacter haemolyticus, Legionella pneumophila, Escherichia coli, Pseudomonas fluorescens, Candida albicans, Chlamydia pneumoniae, respiratorni adenovirus, Enterococcus ali vzorci, ki vsebujejo druge gene, odporne na zdravila, kot so CTX, mecA, SME, SHV, TEM itd. c) Preprečevanje interference: Za test interference so izbrani mucin, minociklin, gentamicin, klindamicin, imipenem, cefoperazon, meropenem, ciprofloksacinijev klorid, levofloksacin, klavulanska kislina in roksitromicin, rezultati pa kažejo, da zgoraj omenjene moteče snovi nimajo moteče reakcije na detekcijo genov za odpornost na karbapeneme KPC, NDM, OXA48, OXA23, VIM in IMP. |
Uporabni instrumenti | Sistemi Applied Biosystems 7500 za PCR v realnem času Sistemi QuantStudio®5 za PCR v realnem času Sistemi za PCR v realnem času SLAN-96P (Hongshi Medical Technology Co., Ltd.) Sistem za PCR v realnem času LightCycler®480 Sistem za detekcijo PCR v realnem času LineGene 9600 PlusFQD-96A,HangzhouBioerjeva tehnologija) MA-6000 kvantitativni termični cikler v realnem času (Suzhou Molarray Co., Ltd.) Sistem za PCR v realnem času BioRad CFX96 Sistem za PCR v realnem času BioRad CFX Opus 96 |
Delovni tok
Možnost 1.
Priporočeni ekstrakcijski reagent: komplet za makro in mikro teste DNA/RNA (HWTS-301)9-50, HWTS-3019-32, HWTS-3019-48, HWTS-3019-96) (ki ga je mogoče uporabljati z avtomatskim ekstraktorjem nukleinskih kislin Macro & Micro-Test (HWTS-3006C, HWTS-3006B)) podjetja Jiangsu Macro & Micro-Test Med-Tech Co., Ltd.. V oborino talusa dodajte 200 μL fiziološke raztopine. Nadaljnji koraki morajo slediti navodilom za ekstrakcijo, priporočeni elucijski volumen pa je100 μL.
Možnost 2.
Priporočeni ekstrakcijski reagent: Reagent za ekstrakcijo ali čiščenje nukleinskih kislin (YDP302) podjetja Tiangen Biotech (Beijing) Co., Ltd. Ekstrakcijo je treba začeti strogo v skladu z 2. korakom navodil za uporabo (oborini talusa dodajte 200 μL pufra GA in stresajte, dokler se talus popolnoma ne suspendira). Za elucijo uporabite vodo brez RNaze/DNaze, priporočeni elucijski volumen pa je 100 μL.
Možnost 3.
Priporočeni ekstrakcijski reagent: Reagent za sproščanje vzorcev za makro in mikro teste. Vzorec sputuma je treba sprati tako, da se zgoraj omenjeni obdelani oborini talusu doda 1 ml fiziološke raztopine, centrifugirati pri 13000 vrt/min 5 minut in supernatant zavrže (shranite 10–20 µL supernatanta). Za čisto kolonijo in rektalni bris dodajte 50 μL reagenta za sproščanje vzorca neposredno zgoraj omenjeni obdelani oborini talusa, nadaljnje korake pa je treba ekstrahirati v skladu z navodili za uporabo.